Отличительная черта ИМОМИ — высокая вариативность исследовательских и образовательных программ, ориентированных на актуальные запросы общества и выполняемых на проектной основе.  Отдельные, наиболее перспективные научные и учебные проекты реализуются специализированными учебно-исследовательскими центрами, в деятельности которых оптимальным образом сочетаются фундаментальные и прикладные аспекты современного гуманитарного знания. Учебно-исследовательские центры: